1.1.4. Electrostatic Matching Analysis
功能介绍
This function utilizes the lattice matching algorithm to generate a series of Interfaces and then screen the Interface configuration by Ewald methods操作流程
依次按照以下步骤创建计算任务
step 1. 新建任务:在对应页面中输入计算任务的名称、描述信息,点击页面的“OK”按钮,完成计算任务的创建;点击“Cancel”按钮,清空输入内容。
step 2. 上传文件:在对应页面按照页面提示上传计算输入文件。
Attention:请务必以英文命名计算输入文件!
如需上传多个计算输入文件,请将其打包为zip格式压缩包进行上传。
step 3. 设置计算参数:在对应页面按照页面提示设置计算参数。
step 4. 设置运行参数:目前,运行参数无需设置,保持输入框默认参数即可
step 5. 保存计算任务:完成计算任务的创建,并将其添加到计算项目中。在跳转的页面中,可选择:
继续添加计算任务:添加新的计算任务
查看项目:查看当前待提交的计算项目详情。
参数说明
- 输入文件:
需提供两个包含化合价信息的cif结构文件: 基底层结构文件base_layer_structure.cif 覆盖层结构文件overlay_layer_structure.cif。
上传时请将两个文件打包成一个zip文件进行上传。
计算参数:
参数名称
参数类型
说明
Method
——
目前共有五种方法以供选择:
Ewald_2D:
Ewald_3D:
Ewald_3DC*:
Ewald3DC_planar_boundary:
Ewald3DC_spherical_boundary:
基底层原子层数
正整数(Int)
单位:周期
基底层米勒指数x轴坐标
浮点数(Float)
基底层米勒指数y轴坐标
浮点数(Float)
基底层米勒指数z轴坐标
浮点数(Float)
覆盖层原子层数
正整数(Int)
单位:周期
覆盖层米勒指数x轴坐标
浮点数(Float)
覆盖层米勒指数y轴坐标
浮点数(Float)
覆盖层米勒指数z轴坐标
浮点数(Float)
界面面积
浮点数(Float)
单位:埃²
最大容忍长度
浮点数(Float)
默认值为0.1
界面间距步长
浮点数(Float)
间距在2.5埃~4埃范围内变化,默认值为2.5
- 运行参数:
目前无需设置,保存默认即可。
参数名称
参数类型
说明
Machine Name
字符串(String )
计算机器名称,默认为machine01
Number of Core
正整数(Int)
计算核数,默认为1
Number of Process
正整数(Int)
计算进程数,默认为1
计算结果文件
out.txt:计算结果
substrate_sp.cif
file_sp.cif
hetero_sp.cif