1.1.1. 计算结构位点的马德隆常数

  1. 功能介绍

      As a classical method for calculating long-range interactions, the Ewald technique decomposes the electrostatic energy into long-range and short-range terms, by calculating two terms in the real space and the reciprocal space, respectively, which results in rapid convergence of the summation.

  2. 操作流程

    依次按照以下步骤创建计算任务

    computational_workflow

    图 1.1 computational_workflow


    • step 1. 新建任务：在对应页面中输入计算任务的名称、描述信息，点击页面的“OK”按钮，完成计算任务的创建；点击“Cancel”按钮，清空输入内容。

    • step 2. 上传文件：在对应页面按照页面提示上传计算输入文件。

      Attention:

      • 请务必以英文命名计算输入文件！

      • 如需上传多个计算输入文件，请将其打包为zip格式压缩包进行上传。

    • step 3. 设置计算参数：在对应页面按照页面提示设置计算参数。

    • step 4. 设置运行参数：目前，运行参数无需设置，保持输入框默认参数即可

    • step 5. 保存计算任务：完成计算任务的创建，并将其添加到计算项目中。在跳转的页面中，可选择：

      • 继续添加计算任务：添加新的计算任务

      • 查看项目：查看当前待提交的计算项目详情。

  3. 参数说明

    • 输入文件：

      包含化合价信息的cif结构文件。示例文件

    • 计算参数：

      参数名称

      参数类型

      说明

      Function

      ——

      计算结构位点的马德隆常数时，默认使用madelung_potential函数

      Method

      ——

      目前共有五种方法以供选择：

      • Ewald_2D：

      • Ewald_3D：

      • Ewald_3DC*：

      • Ewald3DC_planar_boundary：

      • Ewald3DC_spherical_boundary：

      Fractional Coordinate x

      浮点数(Float)

      分数坐标x

      Fractional Coordinate y

      浮点数(Float)

      分数坐标y

      Fractional Coordinate z

      浮点数(Float)

      分数坐标z
    • 运行参数：

      目前无需设置，保存默认即可。

      参数名称

      参数类型

      说明

      Machine Name

      字符串（String ）

      计算机器名称，默认为machine01

      Number of Core

      正整数（Int）

      计算核数，默认为1

      Number of Process

      正整数（Int）

      计算进程数，默认为1

  4. 计算结果文件

    • out.txt：计算结果