Electrostatic Matching Analysis =============================== #. 功能介绍 .. raw:: html   This function utilizes the lattice matching algorithm to generate a series of Interfaces and then screen the Interface configuration by Ewald methods #. 操作流程 **依次按照以下步骤创建计算任务** .. figure:: ../../_static/computational_workflow.png :alt: computational_workflow :align: center computational_workflow .. raw:: html
+ **step 1. 新建任务**:在对应页面中输入计算任务的名称、描述信息,点击页面的“OK”按钮,完成计算任务的创建;点击“Cancel”按钮,清空输入内容。 + **step 2. 上传文件**:在对应页面按照页面提示上传计算输入文件。 .. raw:: html Attention: + **请务必以英文命名计算输入文件!** + **如需上传多个计算输入文件,请将其打包为zip格式压缩包进行上传。** + **step 3. 设置计算参数**:在对应页面按照页面提示设置计算参数。 + **step 4. 设置运行参数**:目前,运行参数无需设置,保持输入框默认参数即可 + **step 5. 保存计算任务**:完成计算任务的创建,并将其添加到计算项目中。在跳转的页面中,可选择: + **继续添加计算任务**:添加新的计算任务 + **查看项目**:查看当前待提交的计算项目详情。 #. 参数说明 + 输入文件: + 需提供两个包含化合价信息的cif结构文件: 基底层结构文件base_layer_structure.cif 覆盖层结构文件overlay_layer_structure.cif。 + 上传时请将两个文件打包成一个zip文件进行上传。 + `示例文件 `_ + 计算参数: ====================== ====================== ====================== 参数名称 参数类型 说明 ====================== ====================== ====================== Method —— 目前共有五种方法以供选择: + Ewald_2D: + Ewald_3D: + Ewald_3DC*: + Ewald3DC_planar_boundary: + Ewald3DC_spherical_boundary: 基底层原子层数 正整数(Int) 单位:周期 基底层米勒指数x轴坐标 浮点数(Float) 基底层米勒指数y轴坐标 浮点数(Float) 基底层米勒指数z轴坐标 浮点数(Float) 覆盖层原子层数 正整数(Int) 单位:周期 覆盖层米勒指数x轴坐标 浮点数(Float) 覆盖层米勒指数y轴坐标 浮点数(Float) 覆盖层米勒指数z轴坐标 浮点数(Float) 界面面积 浮点数(Float) 单位:埃² 最大容忍长度 浮点数(Float) 默认值为0.1 界面间距步长 浮点数(Float) 间距在2.5埃~4埃范围内变化,默认值为2.5 ====================== ====================== ====================== + 运行参数: 目前无需设置,保存默认即可。 ================= ================= ================= 参数名称 参数类型 说明 ================= ================= ================= Machine Name 字符串(String ) 计算机器名称,默认为machine01 Number of Core 正整数(Int) 计算核数,默认为1 Number of Process 正整数(Int) 计算进程数,默认为1 ================= ================= ================= #. 计算结果文件 + out.txt:计算结果 + substrate_sp.cif + file_sp.cif + hetero_sp.cif