Electrostatic Matching Analysis
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#. 功能介绍
.. raw:: html
This function utilizes the lattice matching algorithm to generate a series of Interfaces and then screen the Interface configuration by Ewald methods
#. 操作流程
**依次按照以下步骤创建计算任务**
.. figure:: ../../_static/computational_workflow.png
:alt: computational_workflow
:align: center
computational_workflow
.. raw:: html
+ **step 1. 新建任务**:在对应页面中输入计算任务的名称、描述信息,点击页面的“OK”按钮,完成计算任务的创建;点击“Cancel”按钮,清空输入内容。
+ **step 2. 上传文件**:在对应页面按照页面提示上传计算输入文件。
.. raw:: html
Attention:
+ **请务必以英文命名计算输入文件!**
+ **如需上传多个计算输入文件,请将其打包为zip格式压缩包进行上传。**
+ **step 3. 设置计算参数**:在对应页面按照页面提示设置计算参数。
+ **step 4. 设置运行参数**:目前,运行参数无需设置,保持输入框默认参数即可
+ **step 5. 保存计算任务**:完成计算任务的创建,并将其添加到计算项目中。在跳转的页面中,可选择:
+ **继续添加计算任务**:添加新的计算任务
+ **查看项目**:查看当前待提交的计算项目详情。
#. 参数说明
+ 输入文件:
+ 需提供两个包含化合价信息的cif结构文件:
基底层结构文件base_layer_structure.cif
覆盖层结构文件overlay_layer_structure.cif。
+ 上传时请将两个文件打包成一个zip文件进行上传。
+ `示例文件 `_
+ 计算参数:
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参数名称 参数类型 说明
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Method —— 目前共有五种方法以供选择:
+ Ewald_2D:
+ Ewald_3D:
+ Ewald_3DC*:
+ Ewald3DC_planar_boundary:
+ Ewald3DC_spherical_boundary:
基底层原子层数 正整数(Int) 单位:周期
基底层米勒指数x轴坐标 浮点数(Float)
基底层米勒指数y轴坐标 浮点数(Float)
基底层米勒指数z轴坐标 浮点数(Float)
覆盖层原子层数 正整数(Int) 单位:周期
覆盖层米勒指数x轴坐标 浮点数(Float)
覆盖层米勒指数y轴坐标 浮点数(Float)
覆盖层米勒指数z轴坐标 浮点数(Float)
界面面积 浮点数(Float) 单位:埃²
最大容忍长度 浮点数(Float) 默认值为0.1
界面间距步长 浮点数(Float) 间距在2.5埃~4埃范围内变化,默认值为2.5
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+ 运行参数:
目前无需设置,保存默认即可。
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参数名称 参数类型 说明
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Machine Name 字符串(String ) 计算机器名称,默认为machine01
Number of Core 正整数(Int) 计算核数,默认为1
Number of Process 正整数(Int) 计算进程数,默认为1
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#. 计算结果文件
+ out.txt:计算结果
+ substrate_sp.cif
+ file_sp.cif
+ hetero_sp.cif