1.4.2. 识别相似结构
功能介绍
识别相似的晶体结构，可以选择是否加入额外比较准则：原子类型、原子占据率、原子氧化态、原子磁矩信息，若选择某比较准则，则计算相似度时考虑该准则
操作流程
依次按照以下步骤创建计算任务
图 1.15 computational_workflow
step 1. 新建任务：在对应页面中输入计算任务的名称、描述信息，点击页面的“OK”按钮，完成计算任务的创建；点击“Cancel”按钮，清空输入内容。
step 2. 上传文件：在对应页面按照页面提示上传计算输入文件。
Attention:请务必以英文命名计算输入文件！
如需上传多个计算输入文件，请将其打包为zip格式压缩包进行上传。
step 3. 设置计算参数：在对应页面按照页面提示设置计算参数。
step 4. 设置运行参数：目前，运行参数无需设置，保持输入框默认参数即可
step 5. 保存计算任务：完成计算任务的创建，并将其添加到计算项目中。在跳转的页面中，可选择：
继续添加计算任务：添加新的计算任务
查看项目：查看当前待提交的计算项目详情。
参数说明
- 输入文件：
请上传至少包含两个CIF文件的压缩包，以英文命名
- 计算参数：
参数名称
参数类型
说明
原子类型
布尔值[True（1）,False（0）]
是否考虑站点上的原子类型，False(0)为不考虑
原子占据率
布尔值[True（1）,False（0）]
是否考虑站点上的原子占据率，False(0)为不考虑
原子氧化态
布尔值[True（1）,False（0）]
是否考虑站点上的原子氧化态，False(0)为不考虑
原子磁矩
布尔值[True（1）,False（0）]
是否考虑站点上的原子磁矩，False(0)为不考虑
相似度阈值
浮点数（Float）
默认参数为0.9，用于判断相似与否
- 运行参数：
目前无需设置，保存默认即可。
参数名称
参数类型
说明
Machine Name
字符串（String ）
计算机器名称，默认为machine01
Number of Core
正整数（Int）
计算核数，默认为1
Number of Process
正整数（Int）
计算进程数，默认为1
计算结果文件
计算完成会得到一个CSV格式的文件，该CSV格式文件每一列的含义为
filename:晶体结构文件名
similar_group_id:相似结构组号（在识别相似结构的功能中，若晶体结构具有相同组号，即为比较了结构框架与所选比较准则后，晶体被识别为具有相似结构）
similarity:相似度值，与同一相似结构组中第一个结构相比的相似度
same_group_id:相同结构组号（在识别相同结构的功能中，若晶体结构具有相同组号，即为比较了结构框架、原子类型以及原子占据率后，晶体被识别为具有相同结构）