1.2.2. CAVD计算
功能介绍
CAVD (Crystal structure Analysis by Voronoi Decomposition) is an high-throughput tool that towards better characterization of void space for ionic transport analysis.
Using CAVD, the void space inside ionic crystal can be characterized as the 3D network consisting of interstices, channels between interstices, and bottlenecks of the channels, which are identified and quantified from the position and geometry of Voronoi polyhedra vertices, edges, and faces, respectively. The geometric and topological parameters of the network are then translated into ion transport descriptors. These descriptors form the foundation of machine-learning algorithms to predict and optimize materials properties.操作流程
依次按照以下步骤创建计算任务
图 1.6 computational_workflow
step 1. 新建任务：在对应页面中输入计算任务的名称、描述信息，点击页面的“OK”按钮，完成计算任务的创建；点击“Cancel”按钮，清空输入内容。
step 2. 上传文件：在对应页面按照页面提示上传计算输入文件。
Attention:请务必以英文命名计算输入文件！
如需上传多个计算输入文件，请将其打包为zip格式压缩包进行上传。
step 3. 设置计算参数：在对应页面按照页面提示设置计算参数。
step 4. 设置运行参数：目前，运行参数无需设置，保持输入框默认参数即可
step 5. 保存计算任务：完成计算任务的创建，并将其添加到计算项目中。在跳转的页面中，可选择：
继续添加计算任务：添加新的计算任务
查看项目：查看当前待提交的计算项目详情。
参数说明
- 输入文件：
可以上传单个cif结构文件（需有化合价信息），也可将多个cif结构文件（最多50个）打包为zip格式压缩包上传。
除迁移离子外的其他离子位点占据率需为1的cif结构文件。示例文件
- 计算参数：
参数名称
参数类型
说明
迁移离子
字符串（String）
迁移离子的元素名称
距离容差
浮点数（Float）
单位：Å，默认值为0.02，用于控制生成Voronoi图中的边界和面的精确程度
半径标志位
布尔值（Bool）
默认值为True，表明使用考虑半径的Voronoi分解算法
尺寸下界
浮点数（Float）
给定保存间隙点和瓶颈尺寸范围的下界，默认为0
尺寸上界
浮点数（Float）
给定保存间隙点和瓶颈尺寸范围的上界，默认为10
- 运行参数：
目前无需设置，保存默认即可。
参数名称
参数类型
说明
Machine Name
字符串（String ）
计算机器名称，默认为machine01
Number of Core
正整数（Int）
计算核数，默认为1
Number of Process
正整数（Int）
计算进程数，默认为1
计算结果文件
*_origin.net: 迁移离子的间隙网络，保存间隙网络中的瓶颈、间隙位置和几何尺寸
*.net: 给定下界和上界数值下迁移离子的间隙网络，与 *_origin.net 文件格式一致
*.vesta: 间隙网络可视化文件，可以通过 VESTA 软件可视化该间隙网络
*.resex: 包含完整导通状态信息